MHC영역 유전정보 테스트를 통한 조직적합성 유무 판별 장치

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Title
MHC영역 유전정보 테스트를 통한 조직적합성 유무 판별 장치
Alternative Title
The test device for tissue immuno-compatibility test using SNP and genomic information from MHC region of the human genome.
Inventor(s)
김태형; 박종화; 이성훈; 박대의; 김대수; 강호영; 김병철
Application No.
10-2008-0126074
Registration No.
10-1147690-0000
Publisher
한국생명공학연구원
Abstract
본 발명은 MHC영역 유전정보 테스트를 통한 조직적합성 유무 판별 장치에 관한 것으로서, 더욱 상세하게는 같은 부모로부터 태어난 자식들(2촌 관계)에 있어 조직적합성의 유무를 6번 염색체 단완의 조직 적합성 항원 유전자(HLA) 클러스터가 존재하는 MHC 영역에 해당하는 대용량 SNP 칩데이터를 통해 판별하는 MHC영역 유전정보 테스트를 통한 조직적합성 유무 판별 장치에 관한 것이다. 본 발명인 MHC영역 유전정보 테스트를 통한 조직적합성 유무 판별 장치는, 각각의 유전 정보 분석장치로부터 분석된 두 개체 이상의 유전체 서열 또는 SNP 마커 정보를 입력받는 SNP마커정보입력부와
상기 각각의 유전 정보 분석장치의 데이터 호환성 체크에 의해 공통되는 유전체 서열 또는 SNP 마커 셋을 추출하는 마커셋추출부와
상기 마커셋추출부에 의해 추출된 공통된 유전체 서열 또는 SNP 마커 셋 중 서로 같은 위치에 있는 유전체 서열 또는 SNP마커들에 있어 대립인자(Allele)의 공유 정도를 평가하는 대립인자공유평가부와
상기 대립인자공유평가부에 의해 평가된 정보를 저장하고 관리하는 대립인자공유평가데이터베이스와
상기 대립인자의 공유 정도를 평가한 유전체 서열 또는 SNP 마커 셋을 일정한 간격으로 전체 유전체를 조각내는 유전체조각부와
상기 유전체조각부에 의해 조각된 각각의 유전체 조각에 위치하는 유전체 서열 또는 SNP 마커의 수가 비교할 수 있는 개수인지를 체크하는 마커체크부와
특정 유전체 조각의 유전 타입을 양쪽 모두 일치하는 경우, 한 쪽만 일치하는 경우, 양쪽 모두 일치되지 않는 경우의 3가지 형태의 유전되는 모자이크 조각으로 분류하는 유전타입분류부와
특정 영역에 해당하는 유전체 모자이크 조각 모두가 두 일배체를 완벽하게 공유하는 정도를 평가하여 조직 적합성의 유무를 판별하는 조직적합성유무판별부
를 포함하여 구성되는 것을 특징으로 한다. 본 발명을 통해 같은 부모로부터 태어난 자식들(2촌 관계)에 있어 조직적합성의 유무를 6번 염색체 단완의 조직 적합성 항원 유전자(HLA) 클러스터가 존재하는 특정 MHC영역에 있어 조직 접합성과 관련된 유전정보(두 일배체) 모두가 100%일치할 수 있는 형제를 찾을 수 있게 되어 주먹구구식의 종래의 검사에서 벗어나 효율적이면서도 단시간에 정확한 조직 적합성 유무를 제공할 수 있게 된다. DNA, SNP 마커, 조직 적합성 판별.
Type
Patent
Full Text Link
http://link.kipris.or.kr/link/main/FullDoc.jsp?reg_key=4jLn6RaAi84A7NL71xinaQ%3D%3D=&APPLNO=1020080126074
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